קיבוץ צבעון ממוקם בגליל העליון על הר קלען 1 ק"מ מזרחית לצומת סאסא, ויושב על כביש 89 (מעלות-צפת). הקיבוץ ממוקם בתוך שטחי יער טבעיים, ומתוחם במערב על-ידי נחל צבעון, במזרח על-ידי נחל דישון, בצפון שמורת ברעם ובדרום שמורת הר מירון.